墨卓单细胞ChIP测序

墨卓单细胞ChIP测序

一、产品介绍

本试剂盒通过抗体和 Tn5 酶识别蛋白与 DNA 的结合位点,并靶向切割 DNA 分子。基于液滴微流控技术将经过处理的单个细胞包裹形成油包水结构,并借助带有细胞标签的微球捕获 DNÀ 片段和标记 DNA 分子,实现蛋白与 DNA 位点结合的测序,具有高通量、超高分辨率、超强特异性的特点。目前提供的检测抗体:可选5种组蛋白修饰:H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me31DNA结合蛋白:Rpb1RNA聚合酶 Ⅱ)


二、实验流程


三、产品优势

1、数据可靠,质量稳定


· K562细胞样本测试,抗体使用H3K27ac

· DNA片段捕获水平可达2000+

2、技术前沿,性能出色


· PBMC样本

· 抗体位点H3K4mel,H3K4me3,H3K27me3,H3K27ac

3、分群精准,相互映射


· 单细胞ChIP-seq能实现精准的分群

·  bulk ChlP-seq能相互印证与单细胞RNA-seq数据能完美映射




4、多种抗体,灵活选择


· 已验证6大常用抗体,可满足70%研究需求:

· 5种组蛋白修饰:H3K27ac、H3K4me1、H3K4me3、H3K27me3、H3K36me3

· 1DNA结合蛋白:Rpb1RNA聚合酶 Ⅱ)

· 个性定制

· 提供抗体验证解决方案,可满足个性化科研需求

四、应用案例

1、利用单细胞ChIP-seq解析肿瘤耐药机制

化疗和靶向治疗的耐药性的出现是癌症治疗的一个主要挑战,单细胞RNA-seq将细胞分为7类细胞亚群,发现非耐药细胞中有一个细胞亚群具有耐药潜能。单细胞ChIP-seq揭示H3K27me3的缺失导致耐药性基因的激活并找出了耐药性肿瘤细胞的发育进程。



Grosselin K, et al. Nat Genet.2019.


2、利用单细胞ChIP-seq解析肿瘤复发机制



数据表明样本共分为4类细胞亚群,其中复发肿瘤细胞T1亚群占比最高,该群细胞H3K27me3的信号弱并且细胞干性相关的基因活跃,具有向其他细胞类群发育的潜力。



Steven J.Wu, et al.nature biotechnology.2021